เมื่อวันที่ 13 มกราคม ที่สำนักงานตำรวจแห่งชาติ (ตร.)พ.ต.อ.กฤษณะ พัฒนาเจริญ รองโฆษก ตร. แถลงกรณี พ.ต.อ.ไพรัตน์ ไพพรรณรัตน์ รองผบก.อก.ภ.9 ยื่นฟ้องพล.ต.อ.จักรทิพย์ ชัยจินดา ผบ.ตร. มีคำสั่งโยกย้ายไม่เป็นธรรมว่า ผบ.ตร.มีเหตุผลในการโยกย้าย พ.ต.อ.ไพรัตน์ และขอตั้งคำถามกลับว่า มีพฤติกรรมที่เหมาะสมหรือไม่ เนื่องจากผู้บังคับบัญชามีคำสั่งให้ตัดผม แต่ไม่ปฏิบัติตาม อีกทั้ง พ.ต.อ.ไพรัตน์ ยังไปปลุกปั่นให้นักเรียนที่เข้าอบรมหลักสูตรผู้กำกับวิทยาลัยการตำรวจ ไม่ต้องตัดผมตามระเบียบ

รองโฆษก ตร. กล่าวว่า ทางผบ.ตร.ไม่ได้สนใจในกรณีที่ถูกฟ้องร้อง และมองว่าเป็นเรื่องปกติ ในสมัยที่ ผบ.ตร. เป็นสารวัตรรถสายตรวจ191 ก็เคยถูกโยกย้ายไปเป็นสารวัตรตำรวจสุนัข ซึ่ง ผบ.ตร.ก็ไม่ได้ฟ้องร้อง แต่มองว่าเป็นเรื่องปกติในการทำงาน ยืนยันว่า การโยกย้ายไม่ใช่เรื่องการกลั่นแกล้ง และย้ำอีกว่า การเป็นตำรวจต้องมีระเบียบวินัยและเชื่อว่า ตำรวจส่วนใหญ่ในสำนักงานตำรวจแห่งชาติมีระเบียบวินัย ส่วนการตั้งกรรมการสอบ เป็นหน้าที่ของกองบัญชาการตำรวจภูธรภาค 9 ที่พิจารณาว่า จะตั้งกรรมการสอบหรือไม่

รองโฆษก ตร. กล่าวว่า การออกมาเคลื่อนไหวของพ.ต.อ.ไพรัตน์ในวันนี้ ไม่น่าจะมีนัยยะเกี่ยวข้องกับกรณีที่ ผบ.ตร. ตกเป็นประเด็นในเรื่องไบโอเมตทริกซ์ และมองว่าไม่ได้กระทำเป็นขบวนการ