11 เมษายน 2569 สำนักข่าวต่างประเทศรายงานว่า นายกรัฐมนตรีเบนจามิน เนทันยาฮู ของอิสราเอล กล่าวหา ว่าสเปนกำลังทำสงครามทางการทูตกับอิสราเอล และห้าม 'สเปน' เข้าร่วมศูนย์ประสานงานเพื่อกำกับดูแล "การหยุดยิง" ในฉนวนกาซา

ในแถลงการณ์วิดีโอที่เผยแพร่บนแพลตฟอร์มเอ็กซ์ นายเนทันยาฮู กล่าวว่าอิสราเอลจะไม่ "นิ่งเฉยต่อผู้ที่โจมตีเรา สเปนได้ใส่ร้ายวีรบุรุษของเรา ทหารของกองทัพอิสราเอล ซึ่งเป็นทหารของกองทัพที่มีคุณธรรมมากที่สุดในโลก ดังนั้น วันนี้ผมจึงได้สั่งให้ถอนตัวแทนของสเปนออกจากศูนย์ประสานงานในเมืองคีร์ยัตกัต หลังจากที่สเปนเลือกที่จะยืนหยัดต่อต้านอิสราเอลซ้ำแล้วซ้ำเล่า" 

โดยก่อนหน้านี้ เปโดร ซานเชซ นายกรัฐมนตรีสเปน ได้ออกมาประณามอิสราเอลอย่างดุเดือดในกรณีทิ้งระเบิดถล่มเลบานอน  หลังจากสหรัฐอเมริกาและอิหร่าน ประกาศหยุดยิงชั่วคราว 2 สัปดาห์แล้ว โดยเขาบอกว่า "อิสราเอลละเมิดกฎหมายระหว่างประเทศ ต้องการสร้างความพังพินาศและความทุกข์ทรมานให้แก่คนเลบานอน เช่นเดียวกับที่ทำกับคนปาเลสไตน์ในฉนวนกาซา และยังเรียกร้องให้สหภาพยุโรปคว่ำบาตรอิสราเอล 

ซ้ำกระทรวงต่างประเทศของสเปน ก็ประณามการโจมตีเลบานอนเมื่อวันที่ 8 เมษายน 2569 ที่ผ่านมา ว่า "เป็นความอัปยศต่อมโนธรรมมนุษยชาติ"

ทางรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศอิสราเอล นายกิดิออน ซาอาร์ ยังได้วิพากษ์วิจารณ์นายกรัฐมนตรีสเปน โดยกล่าวว่า รัฐบาลของเขาได้กล่าวหาอิสราเอลและกองทัพอิสราเอลด้วยถ้อยคำที่แสดงถึงการฆาตกรรมโดยใช้เลือดมนุษย์ 

โดยเขาเขียนบนเอ็กซ์ "@gidonsaar"ว่า "อคติที่ต่อต้านอิสราเอลอย่างรุนแรงของสเปนภายใต้การนำของซานเชซนั้นร้ายแรงมาก จนทำให้สเปนสูญเสียความสามารถที่จะมีบทบาทสร้างสรรค์ในการดำเนินการตามแผนสันติภาพของประธานาธิบดีสหรัฐฯ และศูนย์กลางที่ดำเนินการภายใต้แผนดังกล่าว"

เบนจามิน เนทันยาฮู บอกว่า สเปนทำให้กองทัพอิสราเอล หรือ  IDF เสื่อมเสียชื่อเสียง ทั้งที่เป็นกองทัพที่มีศีลธรรมมากที่สุดในโลก สเปนเลือกที่จะโจมตีอิสราเอลแทนที่จะประณามพวกก่อการร้าย ดังนั้นสเปนจึงไม่ใช่พันธมิตรของอิสราเอลอีกต่อไป

ความสัมพันธ์ระหว่างสองประเทศเสื่อมถอยลงนับตั้งแต่ที่อิสราเอลเริ่มสงครามชาวปาเลสไตน์ในฉนวนกาซาในเดือนตุลาคม 2023 ปีต่อมา สเปนให้การรับรองรัฐปาเลสไตน์ โดยรัฐบาลฝ่ายซ้ายของซานเชซได้ออกมาประณามการปฏิบัติที่ไม่เป็นธรรมต่อชาวปาเลสไตน์ในดินแดนที่ถูกยึดครอง

รัฐบาลของซานเชซยังคัดค้านสงครามระหว่างสหรัฐฯ และอิสราเอลกับอิหร่านที่เริ่มต้นเมื่อวันที่ 28 กุมภาพันธ์ และปิดน่านฟ้าสเปนสำหรับเครื่องบินของสหรัฐฯ ที่เกี่ยวข้องกับสงครามดังกล่าว

ศูนย์ประสานงานพลเรือน-ทหาร ซึ่งเป็นฐานทัพที่นำโดยสหรัฐฯ และเป็นส่วนหนึ่งของแผน 20 ข้อของโดนัลด์ ทรัมป์ เพื่อยุติสงครามในฉนวนกาซา มีหน้าที่ตรวจสอบ "การหยุดยิง" และอำนวยความสะดวกในการส่งความช่วยเหลือด้านมนุษยธรรมเข้าไปในฉนวนกาซา

สหรัฐฯ ได้จัดตั้งขึ้นในเดือนตุลาคม เพื่อเป็นศูนย์กลางสำหรับบุคลากรทางทหารและนักการทูตจากประเทศอื่นๆ ในการทำงานร่วมกับอิสราเอลและสหรัฐฯ ในประเด็นด้านความมั่นคงและมนุษยธรรมในฉนวนกาซา แม้จะมี "การหยุดยิง" อิสราเอลก็ยังคงโจมตีฉนวนกาซาเกือบทุกวัน และยังคงมีการจำกัดการส่งมอบความช่วยเหลือที่จำเป็นอยู่