จากกรณีที่ฝ่ายความมั่นคงในจังหวัดชายแดนภาคใต้ ได้เข้าตรวจสอบโรงเรียนเอกชนในจังหวัดปัตตานี โดยสามารถตรวจยึดบัตรATM ที่ใช้คู่กับบัญชีเงินเดือนของครูในโรงเรียนจำนวน 23 ใบ ชึ่งโรงเรียนยึดเอาไว้ จากนั้นเบิกจ่ายเงินเดือนให้ครูต่ำกว่า อัตราที่กำหนดคือ  15000 บาท/ เดือน  โดยอ้างว่านำไปใช้ในกิจการอื่นของโรงเรียนหรือนำไปจ้างครูเพิ่มนั้น

17 พ.ย. 61 นายชลำ อรรถธรรม เลขาธิการคณะกรรมส่งเสริมการศึกษาเอกชน(เลขาธิการ กช.) กล่าวถึงความคืบหน้าในการแก้ไขปัญหาคัง กล่าวว่า  เมื่อเร็วๆนี้ สำนักงานคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน (สช.) ได้มีการประชุมบุคคลที่เกี่ยวข้อง ประกอบด้วย ศึกษาธิการจังหวัด ตัวแทนประธานคณะกรรมการประสานงานและส่งเสิมการศึกษาเอกชนจังหวัด (ปส.กช.) ผอ.กลุ่มส่งเสริมการศึกษาเอกชน ผอ.กลุ่มนิเทศฯ เพื่อวิเคราะห์สภาพปัญหาและหาทางแก้ไข ก่อนที่จะนำผลการหารือเสนอต่อ ปลัดกระทรวงศึกษาธิการ ร่วมแก้ไขปัญหาดังกล่าวต่อไป 

ทั้งนี้ ที่ประชุม ได้สรุปสาเหตุของปัญหา ที่เกิดจากการที่เงินอุดหนุนรายบุคคลในส่วนที่สมทบเป็นเงินเดือนครูไม่เพียงพอกับค่าตอบแทนครู จากการสำรวจข้อเท็จจริงในที่ประชุม ประธาน ปสกช.ยอมรับว่าเป็นปัญหาในทุกพื้นที่ ไม่ใช่เฉพาะภาคใต้เท่านั้น  

นายชลำ กล่าวต่อว่า ปัจจุบันกระทรวงศึกษาธิการ ไม่ได้จ่ายเงินเดือนครูโดยตรง  แต่จะสมทบกับเงินอุดหนุนรายบุคคลของนักเรียนในระดับก่อนประถมและประถมศึกษา ในอัตรา 7,224.50 บาทต่อคน/ปี และ 9,032.50 บาท ต่อคน,/ปี สำหรับระดับมัธยมศึกษา โดนสมทบรวมกับค่าใช้จ่ายพื้นฐาน เป็นค่าใช้จ่ายรายบุคคลที่รัฐอุดหนุนให้  โดยให้โรงเรียนนำเงินจำนวนนี้จ่ายเป็นเงินเดือนครูเป็นอันดับแรก  และที่เหลือจ่ายเป็นการจัดการเรียน การสอน พัฒนาสื่อ วัสดุ อุปกรณ์ ครุภัณฑ์ ปรับปรุงอาคารสถานที่ ฯลฯ ซึ่งพรบ.โรงเรียนเอกชน กำหนดให้โรงเรียนเป็นผู้จ้าง บรรจุ และจ่ายเงินเดือนครูเอง หากโรงเรียนบรจจุครูมากเกินไป จึงทำให้เป็นปัญหาค่าตอบแทนเงินเดือนครูไม่เพียงพอและไม่มีเงินเหลือพัฒนาการเรียนการสอน ในส่วนอื่นๆ

ดังนั้นในการแก้ปัญหา จึงต้องกำชับให้โรงเรียน บรรจุครูและบุคลากรในสัดส่วนที่เหมาะสม ต่อไป สช.อาจต้องกำหนดมาตรฐานการบรรจุครูที่เหมาะสม  สำหรับบางเนื้อหา ที่จำเป็นต้องหาผู้เชียวชาญเฉพาะด้านมาสอน และต้องพิจารณาจ่ายเงินตอบแทนเป็นวิทยากรรายชั่วโมง เพื่อลดภาระค่าตอบแทนรายเดือน  และอาจเสนอให้มีการปรับเงินอุดหนุนสมทบเป็นเงินเดือนครูเพิ่มเติมต่อไป

“ขณะนี้ สช.ได้แจ้งศึกษาธิการจังหวัด และสช.จังหวัด ประสานผู้บริหารโรงเรียนให้ปรับปรุงแก้ไขการจ่ายเงินเดือนครูให้ถูกต้องตามระเบียบ กฏหมายที่เกียวข้องแล้ว” เลขาธิการ กช.กล่าว