วันที่ 5 ธันวาคม 2565 ภายหลังจากที่มีลูกค้าร้องเรียนว่า ได้ใช้บริการผ่านแอพพลิเคชั่นช้อปปิ้งออนไลน์หนึ่ง โดยผูกบัญชีธนาคารเพื่อชำระค่าสินค้าและบริการ ทว่าเกิดความผิดพลาดถูกตัดจ่ายอัตโนมัติเป็นจำนวนหลายหมื่นบาท
ล่าสุด Shopee ได้ส่งข้อความแจ้งถึงผู้ใช้แอพพลิเคชั่น ระบุว่า ประกาศ : เปลี่ยนแปลงช่องทางการชำระเงิน Shopee จะเริ่มทำการปิดช่องทาง “การชำระผ่านบัญชีธนาคาร” เป็นการถาวร ตั้งแต่ 6 ธ.ค.65 เป็นต้นไป โดยคุณสามารถชำระเงินผ่าน พร้อมเพย์, ShopeePay หรือช่องทางอื่นๆ ได้ตามปกติ”