มูลนิธิสิรินธร จัดตั้งขึ้นโดยมีวัตถุประสงค์เพื่อการรักษาพยาบาล (คิลานเภสัช) การศึกษาอบรมวิชาพยาบาล การส่งเสริมพระพุทธศาสนา การก่อสร้างและบูรณะโรงพยาบาล รวมทั้งให้ความร่วมมือกับองค์กรการกุศลอื่นๆ เพื่อสาธารณประโยชน์

สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี พระราชทานพระราชานุญาตให้อัญเชิญพระนามาภิไธยย่อ ส.ธ. ภายใต้พระชฎาล้อมกรอบด้วยแถบผ้าด้านล่าง มีข้อความว่า มูลนิธิสิรินธรเป็นเครื่องหมายของมูลนิธิ

สถานพยาบาลของมูลนิธิสิรินธร ตั้งอยู่ในบริเวณวัดชูจิตธรรมาราม ถนนพหลโยธิน อำเภอวังน้อย จังหวัดพระนครศรีอยุธยา เปิดให้บริการตรวจรักษาพระภิกษุ สามเณร และประชาชนที่อาศัยในบริเวณใกล้เคียงกับสถานพยาบาลของมูลนิธิสิรินธร เมื่อวันที่ 20 กรกฎาคม 2520

ปัจจุบันสถานพยาบาลของมูลนิธิสิรินธรให้บริการตรวจสุขภาพ ฉีดวัคซีนป้องกันโรคต่างๆ แก่พระภิกษุ สามเณร และประชาชน ปีละมากกว่า 1,000 ราย ต่อมาในปี พ.ศ. 2543 ได้เปิดห้องพยาบาลในอาคารเรียนกฤษณเวฬุพุทธาราม ตำบลทองเอน อำเภออินทร์บุรี จังหวัดสิงห์บุรี 

สถานพยาบาลของมูลนิธิสิรินธรทั้งสองแห่งให้บริการโดยไม่เก็บค่าใช้จ่ายใดๆจากผู้ไปขอรับบริการ ในเรื่องต่อไปนี้ ตรวจสุขภาพ รักษาเบื้องต้นทางด้านอายุรกรรมจักษุกรรม และทันตกรรม ดูแลด้านโภชนาการโดยทำโครงการสามเณรน้อยเติบโตสมวัย เพื่อให้สามเณรทุกรูปมีสุขภาพสมบูรณ์

และเมื่อวันที่ 18 ธันวาคม 2565 เวลา09.00 น. สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ทรงมีพระมหากรุณาธิคุณโปรดเกล้าโปรดกระหม่อมให้จัดงาน วันมูลนิธิสิรินธร ประจำปี 2565 เพื่อจัดหาทุนสำหรับบริหารกิจการของสถานพยาบาลของมูลนิธิสิรินธรโดยจัดงาน ณ หอประชุมจุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย

ในโอกาสนี้ สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้ากรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี พระราชทานการแสดงชุด เที่ยวไปในแดนชวา ซึ่งเป็นบทพระราชนิพนธ์ในสมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ทรงระนาดเอกร่วมกับวงดนตรีไทยสายใยจามจุรี และวงดนตรีสากลสโมสรนิสิตจุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย วงอังกะลุง และการจับระบำ โดยคณะศิลปกรรมศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย รวมกับวงกาเมลันสำนักการสังคีต กรมศิลปากร